经济发展要求的管理体制、监督制约机制不可能在短期内健全完善，行政行为、企业行为和市场行为不可能在短期内得到规范和有效约束，社会主义民主法制的健全和完善也需要一个较长的过程。加之社会经济成分、组织形式、就业方式、利益关系和分配方式日益多样化，既为经济发展注入新的活力，又使得我们在改革和发展中既面临着冲破不适应新形势需要的旧有僵化体制、机制、制度和管理的束缚，又面临着应当按规定办事，按程序办事，不能自作主张，自行其是的问题。这就存在着对其是非曲直要有全面的、辨证的、历史的分析和判断。水利审计要坚持实事求是，用“三个有利于”的标准，处理和解决审计中发现的问题。一方面，要坚持原则，依法审计，对违反财经纪律、违反建设项目规定、严重损害国家利益的行为必须认真查处，一查到底，严肃处理。另一方面，审计监督也要不断创新，用辩证思维的方法，具体问题具体分析。对查出的问题，要弄清“是什么”、“为什么”、“怎么样”、“怎么办”。对那些虽然不符合现有的一些规定，但属于改革开放、大胆创新，且有利于水利事业发展的行为，要给予保护；对于工作中或管理上的一般失误，要帮助改正、提高、促进管理。总之，既要严格要求，严格管理，严格监督，又要鼓励探索，锐意改革，积极进取，创造一个生机勃勃的，有利于发展和创新的良好氛围。
三是处理好审计监督与其它监督的关系。在水利审计项目的立项、计划、实施和审计结果利用上，要自觉接受国家审计机关的指导和监督，要把督促检查国家审计决定、审计意见的整改和执行情况作为水利审计工作的一项重要任务。水利审计工作要自觉接受审计协会的指导，加强“管理、宣传、服务、交流”。水利审计工作在充分利用水利审计力量的同时，要适当运用社会审计力量。为了整合审计资源，避免重复审计，内部审计应当充分利用国家审计、社会审计资源和成果，提高审计效率。水利审计部门要自觉与纪检、监察、组织、人事、财务等部门搞好配合和协调，形成监督合力。
四是处理好几种审计类型之间的相互关系。财务收支审计是基本的审计任务，预算执行审计是部门预算改革提出的一项新的审计内容，经济效益审计是内部审计发展到现阶段的新课题，是审计发展的延伸，经济责任审计是对经济责任人所承担的经济责任履行情况进行的审查，管理审计是内部审计发展的必然趋势，审计调查比单纯的审计灵活，触及问题深刻，同时又比一般调查具有反映情况真实准确的特点。在具体审计工作中，要根据水利审计工作的实际，注意几种审计方法有机结合，统筹运用，成果共享。
三、加强领导，把水利审计工作落到实处
1、领导要重视审计工作。一个地方、一个单位，审计工作做得怎么样，有没有权威和威信，很大程度上取决于领导的重视程度。部领导对水利审计工作一直是
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