一、检查考核制度
1、检查考核办法：进一步在检查考核机制上加强改革和完善，将加大农村环境卫生的检查考核力度，继续采取每两个月定期检查考核不少于一次（全年不少于6次），再根据阶段性重点工作进行不定期和暗访（全年不少于6次）检查考核相结合的方式。检查考核继续采取百分制考核办法，年终得出平均分值计算奖惩。对问题较严重的采取录像曝光，解决农村脏、乱、差现象，清除卫生死角。对检查考核情况以简报形式及时通报各单位，保证检查考核制度落到实处。
2、检查考核的范围和标准：依据镇环境卫生长效管理检查标准和评分细则，每次检查（明查、暗访）前明确检查具体范围和内容（原则上每检查2次就要覆盖检查单位全部区域）。
3、检查组组成人员：明确由镇卫生科长、环卫所所长、社区负责人、以及其他人员组成。一般情况下没有特殊情况，主要负责人要出席检查活动，不得缺席。如有特殊情况，可以委派其他人员参加。参加检查人员要认真负责，对检查工作一丝不苟，在检查活动中，不得临阵缺席或退出，要自始自终负责到底。
二、奖惩制度
1、奖惩采取奖优罚劣的办法，对年均分值在60—100分的村（社区）、环卫所给予2—8元/人的人均奖励，对年均分值59分（含59分）以下的村（社区）给予5元/人的人均的罚款，罚款在综合费中扣除。
2、企业卫生费返还跟农村环境卫生考核直接挂钩。企业卫生费返还也坚持奖优罚劣的原则，检查考核将作为一项重要的内容来确定企业卫生费返还的比例。环境卫生工作搞得优秀还要给予另外的奖励，环境卫生工作搞得差的要给予处罚。企业卫生费返还（包括镇农村环境卫生考核奖）的使用原则是专门用于各村（社区）、环卫所农村公共卫生工作和“亿万农民健康促进行动”工作上，不得移作他用。检查考核时将作为一项重要的考核内容。
3、环境卫生考核与村（社区）、环卫所干部的年终报酬重点挂钩。
4、环境卫生检查每次考核不合格（60分以下）的村（社区）、环卫所，由村（社区）主任、环卫所所长写出书面整改报告，并限期整改到位。
5、镇将每次检查考核情况及时通报给各村（社区）、环卫所等单位，并将利用镇有线电视和简报形式通报全镇，并对受罚和2次不合格的村（社区）、环卫所将利用镇有线电视进行重点曝光。
6、镇对环境卫生的奖励和企业卫生费返还，应纳入各村（社区）、环卫所集体收入，得到的奖金按规定提出一定的比例，作为给予有功人员一定的奖励，受罚款的村（社区）、环卫所也要给予主任、所长、分管领导和分片干部经济上一定的处罚。