结合农村实际不断进行理论创新，是农村改革与发展取得成功的一条重要经验。改革开放之初，总结农村家庭承包经营责任制而形成的双层经营理论，突破了人民公社体制，调动了农民的生产积极性，极大地解放和发展了农村生产力。在我国农业以及整个国民经济发展进入新阶段后，为了摆脱城乡二元结构的束缚，提出了一系列战略性结构调整的构想，推动农业不断向广度和深度进军，带来了农村经济的大发展。历史证明，实践基础上的理论创新是社会发展和变革的先导，每一次理论的大突破都带来实践的大发展。实践无止境，理论创新也无止境。在全面建设小康社会的新形势下，解决好“三农”问题，仍然离不开理论创新。
实践和理论发展的要求
发展农村经济要求在理论上有新突破。农业和农村经济发展进入新阶段后，实践中的新问题要求在理论上做出新回答。迎接加入世贸组织和经济全球化的挑战，要有世界眼光，探索出一条符合我国国情和世界农业发展规律的新道路；建立和完善社会主义市场经济体制，要增强改革意识，既充分发挥市场对资源配置的基础性作用，又努力提高政府的宏观调控水平，尽快建立国家对农业的支持保护体系；适应工业化进程加快的趋势，要用工业的理念来改造传统农业，转变增长方式，提高农业的整体素质；农村全面建设小康社会，要有战略思维，发展农村经济，增加农民收入，建设现代农业。只有通过理论创新，用新的理论来指导农村改革与发展的新实践，才能不断促进农村经济的发展。
解决农村矛盾要求在理论上有新突破。随着农业和农村经济结构战略性调整的不断深入，农村面貌发生了很大变化，但农业仍处在爬坡阶段，农村经济发展还面临许多困难和矛盾。农业基础薄弱、农民增收缓慢、粮食产量连年下降、农民权益受到侵害、农村社会事业发展滞后等问题，仍困扰着农业和农村经济发展。这其中既有多年积累的老问题，也有新形势下出现的新问题。各种矛盾相互交织，解决起来难度很大。要解决农业的问题，化解农村的矛盾，就必须坚持理论与实践相结合，一切从实际出发，开拓新思路，寻求新办法。理论上有了突破和创新，认识就容易统一，问题就容易搞准，办法就容易找到。
繁荣农业经济学科要求在理论上有新突破。近些年，农业经济理论有了很大发展，对指导农村改革与发展起到了重要作用。但理论发展和学科建设与形势的要求还不完全适应，一个很重要的原因就是理论创新不够，有的疏于对鲜活实践的关注和提炼，有的还不能从传统理论的禁锢中走出来，还有的盲目照搬照套国外学说。发展“三农”理论、繁荣农业经济学科任重道远。只有突破旧框框，推进理论创新，才能形成中国特色农业经济理论框架，构建完整的农业经济学科体系。
抓住创新的重点
本世纪头20年是全面建设小康社会的重要战略机遇期，也是“三农”理论创新的难得机遇期。理论创新要围绕农业和农村经济的重大问题，贴近农村的实际，服务于我们正在做的事情。当前，应着重在三个方面有所突破、有所创新。
发展的理论要创新。发展是硬道理，是我们党执政兴国的第一要务，理论创新必须为发展服务。当前农业和农村经济工作的主要任务是增加农民收入。现阶段农民增收困难，是农业和农村内外部环境发生深刻变化的突出反映，也是城乡二元结构长期积累的各种深层次矛盾的集中表现。解决农民增收问题，从根本上讲要靠发展，把握好发展的规律，运用好发展的理论。要善于运用非均衡发展理论，发挥比较优势和后发优势，实施优势农产品区域布局，形成优势产业带和特色经济带，实现农业的跨越式发展；善于运用发展阶段理论，把工业化中期阶