实行责任追究，既是党风廉政建设责任制的重要内容，又是落实责任制的要害所在。实施好责任追究，当前有许多有利因素，但也存在一些问题不容我们忽视。
一、责任追究在主观意识方面存在的问题
一是不愿追究。一些地方、部门和单位的主要领导干部，认为查处所辖范围内违规违纪问题，追究主要领导和分管领导的连带责任，是损害了单位和地方形象，影响了政绩。还有就是认为某领导干部虽然构成了失职错误，但由于“一贯表现良好、政绩突出”，功过相抵，因而不愿意追究其应承担的纪律责任。从而对责任追究案件视而不见，不组织力量进行调查，对上级的督办也试图回避，甚至还捂着、掖着。
二是不想追究。责任追究政策性强，工作量大，情况复杂，必须集中精力做大量细致的工作。而当前有些部门领导干部对党风廉政建设没有提上平常工作的议事日程，图简单省事，不愿做具体工作，不把各项任务分解细化，落实到各个领导班子成员和各有关部门头上，并建立相关责任追究制度。导致问题发生时各责任人相互推委，以致认为实施责任追究，费事劳神，搞不好自己还会陷入扯皮是非圈子之中，影响了自身的本职工作，不想去追究。
三是不敢追究。一些领导干部害怕影响改革、发展和稳定的大局，担当改革开放的“绊脚石”的骂名，对应追究责任的领导干部网开一面；还有的认为实施责任追究得罪人，担心得罪了下级失选票，得罪了同级失和气，得罪了上级掉乌纱；还有一些自身不廉，对下属教育不严、治理不力的领导干部害怕责任追究寻根溯源追究到自己头上，因此对违反党风廉政建设责任制规定的人不敢追究责任，或充耳不闻，或轻描淡写不痛不痒的批评几句，或干脆直接包庇护短。
二、责任追究在客观操作方面存在的问题
一是追究主体不明确。实行党风廉政建设责任制，必须坚持中心确定的“党委统一领导，党政齐抓共管，纪委组织协调，部门各负其责，依靠群众的支持和参与”的领导体制，这是多年反腐倡廉实践经验的总结。但这一领导体制由于缺乏强制性的保障措施，在运行上还存在一些缺陷，表现在有的牵头单位和职能部门分工不负责，挂名不干事，工作推一推，动一动，甚至推而不动。造成实际上党风廉政建设各项工作由纪检监察机关“独家经营”，导致责任追究的整体合力难以形成，影响整个责任制的落实。
二是政策界限不明确。有些地区和单位在落实责任制追究中注重直接违纪者处分多，而追究领导责任或连带责任少，非凡是对集体负责、集体决定的事项，借口集体负责，而实际上谁都不负责，导致难以追究个人责任，严重影响了责任制的严厉性。
三是追究手段过于单一。责任追究分为诫勉处罚、组织处理、纪律处分和追究刑事责任四种。但由于前面介绍的追究主体不明确，实施责任追究全部由纪检监察机关负责，各职能部门不能坚持谁司职谁负责追究，涉及几个部门的，追究部门不能牵头协调，其他部门不能做到相互配合。不能根据违反党风廉政建设责任制行为的类型、程度采取相应追究手段，导致责任追究手段单一。
三、对策和建议
责任追究是责任制灵魂，是贯彻执行责任制的重要内容、手段和根本保证。只有较好地解决了上述这些问题，才能发挥责任追究的优势，形成综合效应，保证党风廉政建设责任制落到实处，收到实效。
一是果断排除狭隘的本位主义，各级领导干部要树立正确的政绩观和荣辱观。既要认清党风廉政建设方面不出问题或少出问题是政绩；出了问题，态度积极，措施得力，责任追究严厉认真，并能吸取教训着力预防，建立和完善相关制度防患于未然，这也是政绩。又要认清出了问题，不愿意处理，极力地逃避、回避，既解决不了问题，还可能造成更大的隐患，出现更多的违规违纪行