党的十七大报告指出：“全面推进农村、企业、城市社区和机关、学校、新社会组织等的基层党组织建设，优化组织设置，扩大组织覆盖，创新活动方式，充分发挥基层党组织推动发展、服务群众、凝聚人心、促进和谐的作用”。
可以预测，在国有企业、农村、社区、新社会组织中建立起了党组织后，下一步基层党建发 展方向和工作重点应是：明确和细化不同类型基层党组织的领导体制、功能定位、活动内容，形成各具特色的基层党组织的地位、作用和活动方式。在这一方针的指引下，我们将探索出不同类型的基层党组织的规律和特点。
一、农村——探索领导的对象和方式
如果说，改革开放初期，农村党组织领导的对象是千家万户分散的农民，领导的内容是选准一条发展经济的好路子。那么现在，面对的将是越来越多的自愿组织起来的各种合作组织和村民自治组织。这将是农村经济发展的再次重大变革和政治结构的重新组合。对此，党组织如何处理与农民专业合作组织、村民自治组织的关系，将成为今后农村党组织领导的重点对象和崭新内容。
农民专业合作组织，主要是专业合作经济组织，它不同于以往任何经济组织。它不是把农户的土地、耕畜、农具、资金、劳动力等合并起来，而是保留了农户独立的产权和经营自主权，专门为农户搞好生产、经营而提供服务的，它不以赚取利润为目标，而是以服务农户为宗旨，在组织内部实行一人一票制的民主表决制。这些特点都是党组织需要重新认识并加以尊重的。然而另一方面，它又是弱势个体之间的联合，所以，需要党和政府给以政策、资金的大力引导和强力扶持。对此，党组织必须充分认清和把握它的特征，在引导农民组建合作组织时，既不能包办代替，又要要求党员积极领办、创办，起示范带头作用。实现党组织从包办型向引导型、从管理型向服务型的转变。目前各地试行的“支部+合作社”、“支部+协会”等模式，便是处理二者关系的一个探索。这是对农村党组织领导对象与方式的又一次挑战。
村民自治的出现，使得原有的村党组织一元权力结构变成了村党组织与村委会二元权力结构，而且二者都争着“为民作主”，都有法律和条例作依据，甚至出现了尖锐的矛盾。这就提出了一个深层次的问题：党组织在变化了的政治结构中，如何与村民自治组织有机地结合起来。凌驾于之上或游离于之外，都会出现二元权力结构的矛盾状况。融入或渗透到村民自治组织之中，把党的领导、人民当家作主与依法办事有机地统一起来，应成为解开这一症结的思路。
为此，各地探讨了一些做法。如建立“两委”联席会议制度、实行“两委”成员交叉任职或党政一把手“一肩挑”。 上述做法，减少了“两委”的矛盾与冲突，提高了“两委”的工作效率。然而“两委”集决策、执行、监督于一身，党组织领导权的角色与村委会自治权的角色完全混合在一起了。
对此，河北青县自2002年开始试行的“青县模式”，给我们提供了一个范本。设立村民全体会议为权力组织，拥有重大事务的最终决定权；设立村民代表会议为议事机构，行使日常决策、监督权；村委会为办事组织，负责执行决议以及日常村务管理。村党组织怎样起领导核心作用呢？