年，校共青团工作的指导思想是：高举中国特色社会主义伟大旗帜，以邓小平理论和“三个代表”重要思想为指导，深入贯彻落实科学发展观，认真学习贯彻党的十七大和团的十六大精神，坚持党建带团建，着力构建具有南医大共青团特色的科学工作体系，切实履行共青团的四项基本职能，围绕学校育人根本目标，不断深化思想引领和成长服务两大战略任务，坚持先进文化引领，继续深化“一二三四五六”工程，根据两个“全体青年”政治目标，狠抓基层组织建设和基层工作，为“十二五”开好头、起好步，以实际行动迎接建党90周年。
一、围绕学校育人根本目标，不断加强学生思想引领工作
1、坚持用社会主义核心价值体系教育引导青年。根据团中央《关于在全团开展分类引导青年工作的实施意见》及《思想引导大纲》，配合团省委“青春导航行动”，引导学生把爱国主义和社会主义、民族精神和时代精神、个人成就和社会责任紧密结合，不断巩固和扩大党执政的青年群众基础。
2、推进“大学生青年马克思主义者培养工程”。实施《南京医科大学“大学生青年马克思主义者培养工程”方案》，建立学校、院系级骨干培养人才库，组建培训师资队伍，举办学生骨干培训班，开展主题鲜明、内容丰富、形式新颖的培训课程和挂职锻炼，并认真积极选派优秀学生骨干参加全省和全国培训。
3、以重要纪念活动为载体，引领青年学生思想成长。围绕建党90周年、辛亥革命100周年、五四运动92周年、国庆、“一二·九”等纪念日和端午、中秋等节日，持续推进“红色校园文化年”主题教育活动。
4、探索先进青年典型思想引领新平台。配合全省“我们身边的好青年”海选活动，开展第五届“南医大十佳青年（教职工）”评选，同时通过“青年学子之星”评选、“我的青春故事”大学生成长体验报告会等活动，用身边人、身边事教育引导广大青年，广泛宣传对青年有启发意义的青春创业故事、青春成长故事和青春奉献故事。
5、健全青年学生舆情网络体系。全面贯彻实施高校共青团“红网工程”，完善基层团组织信息员队伍建设。加强共青团“太阳花”网站和《工作简报》、《百艺》、《志愿者之家》等团属传媒的舆论引导。做好团省委、省学联《大学生社会观察导航》的发行工作。
二、健全实践育人工作体系，切实做好学生成长服务工作
6、围绕纪念建党90周年广泛开展主题教育活动。以“追寻红色足迹，奏响青春之歌”为主题，抓住五四、七一、十一等重要时间节点，持续开展“红色校园文化年”活动，将红色文化融入第二十一届校园科技文化艺术节、校园集体舞大赛、“党在我心中”党团知识竞赛、“我们的节日”纪念活动、第九届“阳光杯”新生风采大赛、第十一届学生社团巡礼、团支部拉力赛、迎新晚会、新年音乐会等大型活动。
7、继续深入开展“三百工程”系列活动。通过文化活动进公寓、团支部拉力赛等形式推进“读百部好书，唱百首好歌，吟百首好诗（词）”的“三百工程”深入开展。
8、规范指导学生课外艺术实践活动。引入学生测评和考核淘汰机制，逐步完善学生艺术团体授课老师选聘制度，并尝试礼聘著名专家学者组成顾问团督导教学，不断提高学生艺术团体整体业务水平。召开省第三届大学生艺术展演参赛准备暨团委艺术中心工作座谈会，精心组织参加各项比赛，同时认真完成教育厅委托的5场“高雅艺术进校园”演出任务。配合做好艺术特长生招生工作，论证制定我校独立进行艺术特长生专业水平测试工作方案，摸索适合我校校情的艺术特长生招生机制。
9、深入开展志愿服