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多年来，随着国库在机构设置、人员配备、治理制度、核算方法等诸多方面都渐趋完善。各级国库认真履行职责，积极发挥职能作用，近而不断有效地促进和支持地方经济的发展。然而随着市场经济的高速发展，如何更好地适应财政体制改革的需要，以及人民银行国库监管改制的客观需求，给当今国库工作提出许多新课题亟待每位国库工作人员去积极探索，有效解决。
一、目前国库工作存在的问题
（一）、机构不稳定
《中华人民共和国国库条例中》明确规定，国库按财政治理体制设置，原则上一级财政设置一级国库，而在实际工作中，中心、省、市、县、乡五级国库中，一般中心、省级、市级的国库部门单设都能保证，而作为基层国库的县乡两级相对弱化，乡镇国库几乎为商业银行和信用社的代理，而县支库在个别省市也有商业银行代理的现象，而在大多数省市中，县支库作为县级支行的内设机构，也是经历多次的分合。国库机构的不稳定和从属地位的不确定，使国库部门难以发挥职能作用。
（二）、人员和岗位不对称
在国库条例中规定，国库部门专职工作人员2—3人，而在国库核算系统2.0版岗位设置中，对人员的要求正常业务操作最少6人。这样国库部门的人员配置与岗位要求出现明显冲突，在规定中要求国库部门机构单设，而岗位分工按合设机构设置，这虽然表面上解决了燃眉之急，但绝非长久之计。
（三）、国库监管的难度大
对经收处监管难，国库经收处在经收汇划税款过程中，往往出现延解税款的现象，从对经收处税收入库检查情况看，同城入库有的三天，甚至有的多达5天，乡下汇入的多为一周，有的甚至十多天，出现这种现象的原因，有的因为当时头寸不足，难以划出，另外一个原因是有些经办人员责任心不强，造成漏划，对于经收处造成税款延解积压的，而国库的相关规定对此没有专门规定，国库部门难以进行查处。
（四）、国债兑付难
国债发行和兑付治理是国库部门的基本工作，前几年是国债发行兑付的高峰期，地方政府重视，人民银行主动，商业银行配合，国债兑付和发行工作按部就班有序进行，但由于近几年，市场上无记名国债兑付任务逐步减少，因此，国债兑付工作人民银行难布置，商业银行也不愿配合，一方面他们自己垫付资金，另一方面没有利益可言，只是一种服务措施。因此，国债兑付成为近几年国库工作的一个难点问题。
（五）、调研工作难深入
国库调研是国库工作的重要组成部分，是做好国库治理的主要手段，而在现阶段，由于国库部门在基层行整体占位没优势，因此在人员配备的数量和质量都难以适应基层国库调研工作的要求。一方面国库调研的基础条件差，基层国库人员只能应付正常的核算业务，没有精力进行调研课题的发掘，调研素材的筛选，所以调研工作难以深入。近几年的国库工作内容的变化，财政治理制度的改革，农村税费改革的实施，国库部门只能人云亦云，亦步亦趋地跟随，没有真正的从自身职责出发，比较全面客观的看问题，不能适时反映实际运行中的实际问题，基层国库部门调研职能形同虚设，没有发挥实际效用。
二、解决的对策
近期我国新的财政国库治理制度将在全国逐渐推行，人民银行国库部门的工作范围，工作难度都相应提高。因此为适应形势发展的要求，必须重新审阅国库的定位，调整国库工作
的视角，理顺内部结构，改革外部环境，真正使国库部门发挥职能。（一）、确立独立机构