随着我国经济社会的快速发展，我国高等教育开始进入大众化阶段，大学生就业已实行双向选择，原在普通高等学校招生中实行的《普通高等学校招生体检标准》已不能适应新形势的要求。为此在充分征求高等学校、教育行政部门和卫生部门意见的基础上，教育部、卫生部、中国残疾人联合会制定了《普通高等学校招生体检工作指导意见》（以下简称指导意见），并在2003年普通高等学校招生中实行。
《指导意见》是深入贯彻依法行政、依法治招、进一步扩大高等学校招生自主权，明确高等学校在招生体检方面的责任、深化高等学校招生管理体制改革的重要举措，《指导意见》对普通高等学校录取新生身体状况的要求与原《普通高等学校招生体检标准》主要有五方面的不同。
一、将原《普通高等学校招生体检标准》的两部分，修改为《指导意见》中的三部分
《指导意见》的修改，不只是简单意义上体检条件的修订和体检条目的重新排列，它体现了对所有考生权益的保护，对残疾考生的关爱和以人为本的理念。《指导意见》只作为高等学校录取新生时对其身体健康状况要求的指导性意见。这既维护了弱势群体的利益，又为更多的考生争取了上大学的机会，作为体检部门，我们的体检结论将不再是硬性的，不再作为退档的直接依据，我们只是以《指导意见》为依据，向学校提供一份客观公正的结论，提出意见和建议，供学生报考专业时参考，同时共学校参考。
原《普通高等学校招生体检标准》，共列出33条不能报考或不能录取的疾病和生理缺陷，共涉及到100多个不同专业，措辞是不能录取，而新的《指导意见》细分为“可不予录取6条，限制报考6条，此外有9种情况是学生不宜报考，《指导意见》进一步放宽了对患疾病或生理缺陷者的录取要求。除患有传染性疾病、精神性疾病、血液病、心脏病、高血压等无法无完成学业的疾病及学习不能自理的考生，高等学校可以不予录取外，对患有其他疾病的考生，只要不影响专业学习和其他学生，录取时一般应不受限制。
二、对原体检标准中患有某些疾病或生理缺陷的，在录取专业上进行了调整。
（一）将原《普通高等学校招生体检标准》第一部分学校不予录取的13减为6条，对原1、3、5、6、7、8条中的部分疾病进行了保留与合并。
（二）将原第二部分不予录取的专业由20条调整为6条，仅保留了6、7、8、9、10、19条。
（三）新的《指导意见》将过去体检标准第二部分中的部分条目，划入到新增加的第三部分中，明确了由于所患某种疾病或生理缺陷，不能按专业培养方案完成学业的录取受限专业；对患有不影响专业学习的某种疾病或生理缺陷，但今后对在该专业领域内就业可能有影响的，提出不宜就读专业的指导性建议，考生可根据自身情况选报专业。并明确规定第三部分内容供考生在填报志愿时参考。学校不得以此为依据，拒绝录取达到相关要求的考生，使考生的权利得到了充分的保障。
三、改变了检查结论的称谓
《指导意见》将过去眼科检查中色弱、色盲的称谓，改为轻度色觉异常和色觉异常ⅱ度。这样有利于改变人们过去对色盲、色弱就是不辩颜色的错误理解和认识，可避免录取过程中对色觉反复解释和高校错退档案的现象，方便远程网上录取。
四、放宽了对残疾考生的录取限制
新的《指导意见》，对肢体残疾不影响所报专业学习，且高考成绩达到录取要求的考生，只要不影响专业学习和其他学生，高等学校不能因