为贯彻落实《国家中长期科学和技术发展规划纲要》，明确我国中长期特别是“十一五”渔业科技的发展思路、重大战略目标和任务，提升我国渔业科技创新能力和水平，切实发挥科技对现代渔业发展的引领和支撑作用，带动渔业经济持续健康协调发展，根据《全国渔业发展第十一个五年规划》、《中国水生生物资源养护行动纲要》和《农业科技发展规划》（2006－2020年），特制定《中长期渔业科技发展规划》。
面临的形势
渔业科技发展成就
渔业作为农业的重要产业之一，在促进农村产业结构调整、多渠道增加农民收入、保障食物安全、优化国民膳食结构和提高农产品出口竞争力等方面做出了重要贡献，同时在维护我国海洋权益，参与公海渔业资源开发利用方面也发挥着重要作用。在党的农村政策指引和科技进步的带动下，我国渔业保持了持续快速发展，2006年渔业总产量5290万吨，占世界水产品总量的38%，比“九五”末增加1011万吨，增长了25%；其中，养殖产量达3593万吨，占世界养殖总量的70%，比“九五”末增加1015万吨，增长了40%；渔业总产值达到4433亿元，占农业总产值的10.5%，比“九五”末增加1720亿元，增长了38.9%；水产品出口额93.6亿美元，占全国农产品出口总额的30%，比“九五”末增加55.7亿美元，增长了144%；渔民人均收入达6176元，比“九五”末增加1451元，增长了31%。
我国渔业取得巨大成就的主要原因，一是改革开放政策为产业发展注入了动力和活力；二是“以养为主”方针为产业发展指明了方向；三是科技进步为产业发展起到了重要支撑作用。
“十五”期间，我国渔业科技成绩显著，渔业科技进步贡献率已超过50%。以品种培育、健康养殖技术为重点的科技攻关成效明显，以主导品种、主推技术为重点的渔业科技入户工程深入开展，渔业科研体系建设稳步推进，科研条件进一步改善，科技队伍素质不断提高，特别是在养殖、加工、捕捞和资源养护等重要领域，一大批科技成果得到应用，产生了良好的经济和社会效益。
水产养殖方面 一是水产育种取得新突破。培育了“浦江1号”团头鲂、“黄海1号”中国对虾以及新吉富罗非鱼、“蓬莱红”扇贝等一批优良品种，对发展优质高效渔业起到了重要的促进作用。二是人工繁殖技术不断发展。大黄鱼、大菱鲆、南美白对虾、牙鲆、海参等一大批水产名优种类的育苗和养殖技术相继取得成功，丰富和优化了养殖品种结构，推动了相关产业的发展。三是养殖现代化水平不断提高。工厂化养殖和抗风浪网箱等装备技术快速发展，促进了捕捞渔民的转产转业，拓展了海水养殖业的发展空间。四是以健康、生态为主要目标的标准化养殖技术得到发展。初步建立了疫病监测与防控技术体系，推广了多种健康养殖模式，环保型、功能性饲料得到应用，无公害、绿色产品逐渐增多。
水产品加工 一是水产品冷藏链保鲜技术快速发展，贝类、虾蟹类保鲜加工技术有所突破，淡水鱼保鲜、加工方法不断改进。二是我国水产品加工呈现出综合性、高值化、多品种的态势，形成以小包装、便利化、冷冻冷藏为主，调味休闲食品、鱼糜制品、生物材料、功能保健食品、海洋药物等十多个种类为辅的水产品加工生产体系。三是随着生物化学和酶化学及应用技术的发展，低值水产品和加工废弃物利用水平进一步提高，生产出海洋酶、壳聚糖、海藻化工制品等系列产品。
捕捞与资源养护 一是海洋渔业资源专项调查和信息系统集成取得一批研究成果，为渔业生产和管理提供了科学依据；二是远洋渔业资源的开发，使鱿鱼