实际，组织对本企业范围内所有下属企业和单位进行全面自查，也可组织内部力量进行专项审计或检查。自查面必须达到100%，确保不走过场、不留死角。
要建立自查自纠工作承诺制和公示制，市治理“小金库”领导小组办公室将印发《国有及国有控股企业自查自纠工作承诺书》，各国有企业负责人对自查自纠情况负完全责任，并将自查自纠情况在企业内部以不同形式进行公示，接受群众监督。对于专项治理中瞒报漏报自查自纠信息的，将严肃追究责任单位和相关责任人员的责任。为保证自查自纠效果，各主管部门要有重点地进行督促指导，及时做好政策解释和培训工作，确保自查自纠工作落到实处，取得实效。
自查自纠工作结束后，各国有企业要向有关主管部门报送自查自纠总结报告和《国有及国有控股企业“小金库”自查自纠情况报告表》（见附件1），由各主管部门统一汇总，并于年月日前将自查自纠总结报告和《国有及国有控股企业“小金库”自查自纠情况统计表》（见附件2）的纸质文件和电子版报送市治理“小金库”工作领导小组办公室。
（三）重点检查
在自查自纠基础上，市治理“小金库”工作领导小组办公室组织重点检查组，对全市国有及国有控股企业开展重点检查，重点检查比例不低于国有企业户数的20%，每户重点检查企业的重点检查面应当不低于所属子企业户数的20%。此外，市财政、审计、税务部门可结合党政机关、事业单位和社会团体“小金库”治理工作，以及会计信息质量检查和企业审计等日常工作，根据专项治理工作实际和群众举报情况加强“小金库”问题检查。
重点检查应当关注以下国有企业及其所属单位：
1.关系国家安全和国民经济命脉、在国民经济中处于基础和支柱地位的企业或单位；
2.供水、供气、供热、供电等与人民群众生活密切相关的企业或单位；
3.投资链条较长、分支机构多的企业或单位；
4.未纳入合并报表范围的表外资产金额较大的企业或单位；
5.以前年度发现存在“小金库”的企业或单位；
6.有群众举报的企业或单位；
7.自查自纠措施不得力、工作走过场的企业或单位。
重点检查结束后，重点检查组要填报《国有及国有控股企业“小金库”重点检查情况统计表》（见附件3），并撰写重点检查总结报告，于年月日前将纸质文件和电子版报送市治理“小金库”工作领导小组办公室汇总。
（四）整改落实阶段
各主管部门及国有企业要针对专项治理过程中发现的问题，在统一政策标准的基础上，按照职能分工，由各相关部门依法下发处理处罚决定。要针对专项治理工作中发现的问题，紧密结合企业内部管理、完善法人治理结构、深化企业改革发展，制订切实有效的整改措施，扎实抓好整改落实工作，做到责任明确、整改及时、处理到位。在整改过程中要强化源头治理，完善制度，建立防治“小金库”的长效机制。各主管部门要加强对整改落实情况的督促指导。
各主管部门及国有企业要将专项治理工作情况形成书面报告，于年月日前将纸质文件和电子版报送市治理“小金库”工作领导小组办公室。
四、专项治理的处理原则
对专项治理中发现的“小金库”，要严格按照“依纪依法，宽严相济”的原则进行处理。
（一）对自查发现的问题从轻从宽处理。凡自查认真、纠正及时的，对责任单位可从轻、减轻或免予处罚，对有关责任人员可从轻、减轻或免予处分