品粗加工、初级加工向精深加工、系列加工发展；产业功能不断扩展，由带动产业发展、促进农业增效农民增收单纯经济功能，向发展产业、改造农村、培养农民综合功能拓展。这一系列重大深刻变化，要求农业产业化由传统农业、生产经营方式落后的低层次向现代农业、现代科学治理方式的高层次转化升级。
三是农业产业化组织创新问题。农业产业化快速健康发展，有赖于农业产业化组织的创新和提高，非凡是担负桥梁纽带作用的新型合作经济组织和中介组织服务发育发展。目前，农民专业合作经济组织、专业生产合作社、专业协会和行业协会、农民经纪人队伍发育滞后、环境不优、政策支持不够等问题，在较大程度上制约的农业产业化发展。
四是利益联接机制完善问题。利益联接机制是农业产业化经营健康持久发展的要害。目前，龙头企业与基地农户利益联接机制不健全、联接关系不紧密的问题十分突出，是农业产业化深化升级的瓶颈制约，已成为新阶段农业产业化发展面临的亟待解决的重大课题。
五是综合作用发挥问题。目前，农业产业化发展对带动农业结构战略性调整、发展现代产业体系、促进农业增效和农民增收等经济功能相对发挥较好，但带动农村工业化城镇化、培养现代新型农民、改善农村组织结构和乡村治理方式、发展农村社会事业等社会功能作用发挥不够，远不能满足现代农业发展和新农村建设的需要。
四、深化升级的对策措施
针对当前农业产业化经营面临的形势和发展中存在的突出问题，围绕发展现代农业、推进新农村建设的任务要求，加快推进农业产业化经营深化升级的总体要求是，坚持以科学发展观为指导，全面落实各级扶持农业产业化政策措施，突出工作重点，狠抓要害环节，搭建平台，配套政策，完善机制，培育典型，培育队伍，营造环境，推动农业产业化经营又好又快发展。一是搭建一个平台，建立农业产业化经营组织保障体系。根据农业产业化经营在发展现代农业、推进新农村建设中的战略地位和重要作用，各级进一步加大对农业产业化经营的决策指导和组织协调力度，搭建起一个高层决策、高效运作、高水平治理的发展平台，建立农业产业化经营工作联席会议制度，负责制定政策和研究重大问题；设立专门办公室，负责调度指导和日常治理。
二是出台一套政策，完善农业产业化经营政策支撑体系。根据中心和省1号文件对扶持农业产业化发展的要求，立足实际，认真总结汲取原来扶持政策，在深入调研的基础上，尽快研究制定扶持力度更大、扶持范围更广、扶持效果更好、更具操作性，包括财政扶持、税费减免、金融支持、费用优价、服务支持等在内的配套政策。
三是完善一个机制，健全农业产业化经营推进发展体系。引导农业龙头企业以完善利益联接机制为核心，逐步建立健全经营行为约束机制、风险防范化解机制、利润返还机制、矛盾问题化解协商机制，通过农业产业化经营机制的创新发展，不断完善农业产业化经营推进发展体系。
四是培育一批典型，形成农业产业化经营舆论引导体系。充分发挥典型的示范引导和辐射带动作用，认真总结培养一批不同地域、不同产业、不同类型的农业产业化经营典型，非凡是推进农业产业化深化升级、发展现代农业推进新农村建设的典型,通过新闻媒体和现场会、报告会、参观考察等多种形式，多渠道进行宣传推广，逐步形成农业产业化经营的典型示范和舆论引导体系。
五是培育一支队伍，建立农业产业化经营信息反馈体系。加强农业产业化经营体系和队伍建设，通过专题培训学习，系统全面把握农业产业化经营专业知识，提高决策参考、调研分析、综合判定技能，及时反馈政策执行中的情况