一世为了筹措军费反抗苏格兰人，不得不在1640年4月13日下令召集已停开了11年的议会。但是这届议会拒绝通过国王所需要的经费，并且对国王的专制统治及宗教政策进行了猛烈抨击。查理一世在气恼之下，在5月初又将它解散。
但是苏格兰起义仍在不断扩大，解散议会无助于军费的解决。查理一世又不得不在1640年11月3日从新召开议会，这届议会断断续续存在到1653年，史称“长期议会”。“长期议会”的召开标志着英国资产阶级革命的开始。
1642年8月22日查理一世在诺丁汉的卡塞尔山顶升起了王党的军旗，对议会宣战，从此开始了内战。在内战中，资产阶级、新贵族、自耕农和城市平民，他们大多是清教徒，并参加了议会军，这支军队在清教徒的闻名代表人物克伦威尔的指挥下打败了王党军队。1649年1月30日查理一世在白厅前被斩首，5月19日英国被公布为共和国。
议会的胜利与王党的失败，除了政治、经济、军事的因素外，还有宗教的因素。
首先，查理一世在宗教政策上的失误，非凡是爱尔兰事件
加速了他的灭亡。⑻
从17世纪，非凡是30年代后，一直流传着天主教徒将阴谋推翻新教国家，对新教徒进行大肆屠杀的传闻。长期议会召开后，资产阶级反对派就指控斯特拉夫伯爵在爱尔兰招募军队，计划借爱尔兰的天主教军队颠覆英格兰新教在教会和国家领域中的地位。⑼爱尔兰起义使查理一世受到传闻的不利影响。
1641年10月，爱尔兰因担心国王在与议会的斗争中失败而殃及天主教徒，发动了起义。议会坚信，爱尔兰“叛乱”是罗马天主教徒干的事情，同时也是“万恶的国王的谋士们”搞的阴谋。⑽
内战爆发后，查理一世为了对付议会军曾于1643年和1645年两次同意与爱尔兰天主教同盟“休战”。这使人们越来越相信，他欲利用爱尔兰天主教军队来摧毁英格兰议会。⑾于是，广大人民群众在议会的保卫基督事业、抵御天主教的反扑的号召下，加入了资产阶级反封建的队伍。不论是克伦威尔的“铁骑军”，还是以后的新模范军，其中大多数是信仰清教的自耕农和城市平民。
其次，议会实施了有利的宗教政策，虽然并非一帆风顺，但最终赢得了胜利。
内战爆发后，由长老会把持了长期议会。1642年12月首先将主教赶出议会，接着取消英国国教。1646年废除主教制。为了得到苏格兰的军事支持，双方议会于1643年9月签定了“庄重的同盟和圣约”。苏格兰派出2万多人的军队，帮助议会军，王党军队在两军打击下失败。此后长老派把长老会确定为英国国教，禁止其他教派举行“圣会”，其宗教政策同时引起了以独立派为首的社会各阶层以及苏格兰的不满。苏格兰长老会倒向国王，而长老派为保政权只得与国王和苏格兰妥协，下令解散受独立派控制的军队。国王乘机发动第二次内战，独立派与平等派捐弃前嫌，取得内战胜利，并将长老派赶出议会。独立派上台后实行较为宽容的宗教政策，但是这种宽容是有限的，他们拒绝废除什一税，果断镇压平等派和掘地派。其政策的失误和军队的腐化最终招致了斯图亚特王朝的复辟。⑿
四
1658年克伦威尔去世，英国国内一片混乱。1660年5月，查理登上王位，称查理二世，开始了斯图亚特王朝的复辟统治。
1661年，查理二世颁布“市镇团体法”，要求各城市公务人员必须采用英国国教的圣餐仪式。1664年又要求一切牧师必须承认国教的基本教义，并宣誓绝不反对国王和国教教会。上述法令的颁布并非出于单纯的宗教狂热，而是有其政治目的的。在经过两次内战之后，许多城镇的市政权力把握在长老派和独立派手中，法令的颁布意在取消资产阶级对地方政权的控制，并以信仰英国国