按照中央深入学习实践科学发展观活动的部署和要求，铁道部党组根据自身查找的问题和从各方面征求到的意见，在分析检查报告的基础上，经过认真梳理和研究，制定如下整改落实方案。
一、指导思想
贯彻落实中央关于“提高思想认识、解决突出问题、创新体制机制、促进科学发展”的目标要求，紧紧围绕建设和谐铁路、服务人民群众，扎扎实实抓整改，着力转变不适应、不符合科学发展要求的思想观念，着力解决影响和制约和谐铁路建设的突出问题以及党性党风党纪方面职工群众反映强烈的突出问题，着力创新保证和促进和谐铁路建设的制度机制，把科学发展观贯彻落实到铁路工作的各个方面，努力实现铁路的加快发展、创新发展、集约发展、安全发展和全面发展，为经济社会又好又快发展作出更大贡献。
二、工作原则
——坚持分类分步。根据整改问题的不同情况，分门别类制定整改措施。对当前能够解决的问题，坚持立即整改；对近期能够解决的问题，提出明确的进度和要求，限期予以解决；对短期内难以解决的问题，在认真调查研究的基础上，提出对策措施，逐步加以解决。
——坚持统筹兼顾。既突出研究解决涉及全局的重大问题，又注重解决工作中的具体问题；既突出解决制约科学发展、和谐发展的关键问题，又注重解决群众反映强烈的党性党风党纪方面的问题；既充分考虑解决问题的必要性，又注重整改措施的可行性，尽力而为，量力而行。
——坚持分工负责。坚持“四明确一承诺”：明确整改落实项目，明确整改落实目标和时限要求，明确整改落实措施，明确整改落实责任，对整改落实作出公开承诺。建立健全整改落实责任制，把整改责任逐项分解落实到部门和人头。对需要多个部门和有关单位共同解决的问题，确定牵头部门和配合部门，制定上下互动、左右联动、可操作性强的措施。
——坚持依靠群众。在制定整改方案时，广泛听取基层单位和群众的意见，使整改落实的工作目标、方式方法和时限要求符合工作实际、体现群众期盼。整改落实方案制定后，采取多种形式向党员干部和群众公布，并根据整改内容作出公开承诺，接受监督。整改落实情况要向党员、群众通报。
三、总体目标
——认真研究解决群众反映强烈的突出问题，通过办成一批群众看得见、摸得着的实事，让群众切实感受到铁路学习实践科学发展观活动带来的新变化。
——认真研究解决影响和制约和谐铁路建设的突出问题，通过树立科学发展理念、理清科学发展思路、制定科学发展措施，促进铁路加快发展、创新发展、集约发展、安全发展和全面发展。
——认真研究解决党员干部党性党风党纪方面的突出问题，通过加强党员领导干部的党性修养，树立和弘扬良好作风，进一步推进铁路反腐倡廉建设，始终保持党的学习。
——认真研究解决体制机制建设中存在的突出问题，通过建立健全符合科学发展观要求的体制机制、政策法规和规章制度，建立起保障铁路科学发展的长效机制。
四、内容和措施
落实“把解决问题、完善体制机制贯穿始终”的要求，抓住影响和制约和谐铁路建设、群众反映强烈、近期具备整改条件的突出问题，坚持边学边改、边查边改、集中整改相结合，确定了近期需要解决的15个问题。
依据部党组分析检查报告中提出的6个方面的突出问题和3个方面的原因，细化分解成19个需要中长期整改解决的问题。
对以上两类问题，逐一明确了整改项目、内容、目标、措施、责任人、责任部门和完成时间。
五、长效机制建设
着眼到2012年和2020年和谐铁路建设战略规划，进一步巩固和发展开展学习实践活动取得的学习成果、实践成果和制度