中央国家机关是履行党的执政职责、体现党的执政能力的高层机关，搞好党组（党委）中心组学习，推动学习贯彻“三个代表”重要思想不断深入，至关重要。近年来，中央国家机关各部门党组（党委）中心组认真贯彻中央的有关要求，大力弘扬理论联系实际的马克思主义学风，着力在武装头脑、指导实践、推动工作上下功夫，不断提高领导班子思想政治建设的水平和执政兴国的本领。
一是联系思想实际深入学，在加强党性修养、改造主观世界上见成效。各部门中心组坚持学习理论与改造主观世界相统一，努力树立正确的世界观、人生观、价值观，着力解决好权力观、地位观、利益观问题。人事部提倡中心组成员坚持每天挤出1—2个小时、每周双休日拿出半天时间读书自学，着力提高思想理论水平。安全部党委开展以坚定理想信念为核心的“对党绝对忠诚”教育，切实把“三个代表”重要思想转化为坚定的政治信仰。最高人民法院党组以“公正与效率”为主题，认真学习贯彻“三个代表”重要思想，落实司法为民的要求。各部门通过学习，普遍提高了对实践“三个代表”重要思想和贯彻执行党的路线方针政策的认识，增强了以“三个代表”重要思想统领自身工作的自觉性。
二是联系工作实际深入学，在促进发展、解决问题上见成效。各部门中心组坚持学习理论与指导实践相结合，努力把学习的成果转化为促进发展的正确思路、推动工作的有效办法、解决问题的实际行动。交通部党组中心组通过学习，形成了着眼于解决“三农”问题、实现交通跨越式发展的思路，去年完成新改建农村公路10万多公里，使西部除西藏外的地区实现了县县通油路。中国残联党组中心组在广泛调研的基础上推动形成了《残疾人就业保障条例》，残疾人就业率由过去的不到50％提高到85％以上，1000多万残疾人摆脱了贫困。铁道部、农业部等许多部门中心组普遍把如何让群众受益贯穿于学习的全过程，带头深入基层调查研究，帮助群众解决实际困难和问题。部级领导干部普遍达到了中央规定的下基层一个月的要求。
三是联系机关实际深入学，在推进依法行政、提高管理水平上见成效。各部门中心组按照执政为民的要求和建设法治政府的目标，以“三个代表”重要思想为指导，对政府部门自身建设中一些带全局性的问题进行深入的理论思考和研究，采取有力措施，推进了机关建设。国务院机关党组中心组带头创建学习型领导班子，带动国务院办公厅创建学习型机关和学习型队伍，促进了机关决策服务能力、依法行政能力和应急能力的提高。国家发改委党组在全委开展“推进三个转变、树立机关新风”活动，形成了“民为本、国为重、人求进、事求实、懂大局、讲团结、淡名利、守清廉”的机关文化建设要求。许多部门中心组通过认真学习宪法和行政许可法，转观念、变方式、求实效，进一步增强了改革行政管理体制、推进依法行政的自觉性和主动性。
在学习贯彻“三个代表”重要思想的过程中，中央国家机关工委坚持把推动各部门中心组的学习作为一项重要任务，努力搞好指导和服务。一是围绕中央确定的重点学习任务，开展专题研讨、课题研究、理论征文等活动；利用简报和报纸杂志，及时宣传各部门中心组学习的好经验、好做法，推动学习不断深入。二是按照中央的有关精神，制定中心组学习管理办法，加强对部门中心组学习情况的日常管理和督促检查。三是加强对学习秘书的指